培养皿在使用前先进行清洁和消毒，因为培养皿是否干净对实验工作有较大影响，这可能会影响培养基的pH值。如果有某些化学物质，它将压制细菌的生长，新购买的培养皿应先用水冲洗，然后在质量分数为1%或2%的盐酸溶液中浸泡数小时，以除去游离的碱性物质，然后用蒸馏水冲洗两次。要培养细菌时，请使用高压蒸汽(通常为Pa高压蒸汽的5幂的6.8 * 10)，在120℃的温度下灭菌30分钟，在室温下干燥或用干热灭菌，即将培养皿放在烘箱中，将温度控制在约120℃并保持2小时，这可以杀死细菌的胞牙。

在清洗培养皿时，培养皿通常经历浸泡，刷涂，酸洗和冲洗四个步骤，我们这里主要讲解玻璃培养皿，玻璃器皿应浸泡在清水中以软化并溶解附件，新玻璃器皿在使用前要用自来水短暂擦洗，然后在5%盐酸中浸泡过夜。用过的玻璃培养皿通常会伴有大量的蛋白质和油脂，干燥后不易擦洗，因此使用后应立即浸入清水中进行擦洗。

将浸泡过的玻璃培养皿放入洗涤剂水中，然后用软刷反复擦洗，不要留下死角，以免损坏餐具的表面光洁度，清洗干净的玻璃培养皿，将其干燥，然后准备酸洗。

酸洗是将上述器皿浸入清洁溶液中，该溶液也称为酸溶液，该溶液通过酸溶液的强氧化作用除去器皿表面上可能残留的物质，酸洗时间应不少于六个小时，通常是一整夜或更长时间。

擦洗和酸洗后的培养皿要用水充分冲洗，酸洗后是否将培养皿清洗干净直接影响细胞培养的成败。手动清洗浸泡的餐具，每个器具要反复“充空”至少15次，然后浸入蒸馏水中2-3次，干燥或干燥后包装以备后用。